Preguntas frecuentes de la Certificación de Empresa Emergente de Enisa 2025

La certificación de empresa emergente tiene como objetivo principal reconocer a aquellas empresas que están comprometidas con la innovación y que cumplen con una serie de requisitos específicos. Se trata de una certificación que aporta beneficios y ventajas fiscales a las empresas de reciente creación.

En el artículo de hoy resolvemos alguna de las preguntas más frecuentes.

¿Se pueden certificar autónomos?

No, sólo se pueden certificar empresas constituidas como sociedades de Capital (SL, SA, SAL, SLL, etc) y cooperativas que cumplan con los requisitos establecidos por la Ley.

¿Un mismo emprendedor puede ser socio de varias empresas certificadas?

A efectos de la nueva Ley de Startups, si puedes ser socio de una o varias empresas certificadas.

¿Cuánto tiempo dura la certificación como Empresa Emergente?

La vigencia de la certificación está condicionada a que se dé cualquiera de las siguientes situaciones:

  • Dejar de cumplir cualquiera de los requisitos previstos en el artículo 3 y en particular, al término de los cinco o siete años desde la creación de la empresa emergente.
  • Se extinga la empresa antes de ese término.
  • Sea adquirida por otra empresa que no tenga la condición de empresa emergente.
  • El volumen de negocio anual de la empresa supere el importe de diez millones de euros.
  • Llevar a cabo una actividad que genere un daño significativo al medio ambiente conforme al Reglamento (UE) 2020/852 del Parlamento Europeo y del Consejo de 18 de junio de 2020 relativo al establecimiento de un marco para facilitar las inversiones sostenibles y por el que se modifica el Reglamento (UE) 2019/2088.
  • Los socios que sean titulares, directa o indirectamente, de una participación de al menos el 5% del capital social o administradores de la empresa emergente hayan sido condenados por sentencia firme por los tipos delictivos incluidos en el artículo 3.3.

Sobre la reducción del tipo impositivo del Impuesto sobre Sociedades al 15%. ¿Qué pasa cuándo la empresa no tiene beneficios? ¿Cuál es la limitación temporal y cómo realizar la activación? 

La aplicación del tipo impositivo reducido del 15% se hará efectiva durante el primer año en el que se obtengan resultados positivos y los tres siguientes, siempre y cuando se mantenga la condición de Certificado de Empresa Emergente (máximo de 5 o 7 años de antigüedad, en función de la tipología de empresa). 

Por su parte, la exoneración de realización de pagos fraccionados a cuenta del Impuesto sobre Sociedades se aplicará durante los dos primeros períodos impositivos posteriores a aquellos en los que la base sea positiva siempre que en ellos se mantenga la consideración de empresa emergente.

También existe la posibilidad de solicitar un aplazamiento en el pago de la cuota del Impuesto sobre Sociedades sin necesidad de aportar garantías y sin que se devenguen intereses de demora. Estos aplazamientos se prevén para los dos primeros períodos impositivos en los que la cuota resulte a ingresar y será de 12 meses en el primero y de 6 meses en el segundo.

¿Qué mejoras ofrece el Certificado de Empresa Emergente para la entrega de Stock Options a empleados?

Con el objetivo de atraer talento y dotar de una adecuada política retributiva a la situación y necesidades de estas empresas, como explica la propia ley, se mejora la fiscalidad de las fórmula retributivas que se basan en la entrega de acciones o participaciones a los empleados (stock options).

El importe de la exención aumenta de los 12.000 a los 50.000 euros al año si se entregan acciones o participaciones a los empleados de empresas emergentes.

Esta exención también se aplica cuando esa entrega se realice a consecuencia del ejercicio de opciones de compra que se han concedido previamente a aquellos.

Además, para la parte del rendimiento del trabajo en especie que exceda de esa cuantía, se crea una regla especial de imputación temporal. Según la misma, se puede diferir su imputación hasta el período impositivo en el que se den ciertas circunstancias, y en todo caso, en un plazo de 10 años desde la entrega de acciones o participaciones.

La última novedad en este aspecto es que se establece una regla especial de valoración de los rendimientos del trabajo en especie, con el fin de aclarar el valor correspondiente a las acciones o participaciones concedidas a los trabajadores de startups.

¿Cómo funciona la bonificación de las cuotas a la Seguridad Social a favor de los emprendedores autónomos que también trabajen por cuenta ajena?

Para las startups que cuenten con trabajadores autónomos en su plantilla o equipo fundador, la obtención de la certificación posibilita la bonificación integral de la cuota correspondiente a la base mínima del Régimen Especial de la Seguridad Social de los Trabajadores por Cuenta Propia o Autónomos durante los tres primeros años, sujeta a la condición de que dicha entidad conserve su estatus de startup certificada como empresa emergente.

¿Es obligatorio informar sobre la certificación para acceder a sus ventajas?

La condición de ser una empresa emergente registrada en el Registro Mercantil o en el Registro de Cooperativas correspondiente será requisito necesario y suficiente para beneficiarse de las ventajas y disposiciones especiales contempladas en esta ley.

ENISA proporcionará la documentación certificada que confirme el cumplimiento de todos los requisitos necesarios para obtener la condición de empresa emergente directamente al Registro Mercantil o al Registro de Cooperativas competente.

¿Qué implica el silencio administrativo en el trámite de la Certificación de Empresa Emergente? 

Si transcurridos los 3 meses mencionados no se emite una resolución, el silencio administrativo se entenderá como una aprobación de la solicitud de certificación, conforme a lo establecido en el artículo 8 de la Orden y en el apartado 4.2 de la Ley 28/2022.

¿Cuándo pueden denegar la solicitud de certificación de empresa emergente?

Desde la plataforma de ENISA, en todo caso, la certificación puede ser denegada si el modelo de negocio plantea dudas razonables sobre posibles riesgos en términos reputacionales, regulatorios, éticos o especulativos. 

La autoridad competente para tomar decisiones al respecto es el Consejero Delegado de ENISA, con la posibilidad de delegar esta facultad. Sin embargo, todas las resoluciones de ENISA en relación con la certificación pueden ser impugnadas a través de los procedimientos administrativos y/o judiciales correspondientes.

En caso de resolución negativa… ¿Existen posibilidades de recurso?

En caso de que la resolución sea negativa, existe la posibilidad de presentar un recurso de alzada dentro de un plazo de un mes a partir de la recepción de la notificación, conforme a lo dispuesto en los artículos 121 y siguientes de la Ley 39/2015. Para facilitar este proceso, podrá realizarse de forma electrónica a través del sitio web del Ministerio de Industria, Comercio y Turismo.

En el caso de que el recurso de alzada sea desestimado, agotando así la vía administrativa, existe la opción de presentar un recurso contencioso-administrativo ante la jurisdicción judicial, según lo establecido en el artículo 114 de la Ley 39/2015.

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