El EIT cuenta con diferentes Comunidades de Conocimiento e Innovación. Cada una de ellas trata de encontrar soluciones a un desafío global específico. Además, pueden desarrollar productos y servicios innovadores, originar nuevas compañías y entrenar a una nueva generación de emprendedores.
Actualmente, el EIT se divide en 9 comunidades o grupos de trabajo, que quedan definidos en:
-EIT Climate-KIC
-EIT Digital
-EIT Food
-EIT Health
-EIT InnoEnergy
-EIT Manufacturing
-EIT RawMaterials
-EIT Urban Mobility
-EIT Culture & Creativity
Además, mediante EIT Alumni, la entidad ofrece soporte a todos sus graduados y antiguos alumnos independientemente del grupo al que pertenezcan, el área en la que estén especializados o en qué parte del mundo vivan.
Cada una de las Comunidades de Conocimiento e Innovación llevan a cabo actividades que abarcan toda la cadena de innovación: desde programas de formación y educación, pasando por todo el recorrido de la investigación en su llegada al mercado, hasta la puesta en marcha de aceleradoras e incubadoras.
El EIT financia a las comunidades de innovación hasta un máximo del 25%, lo que permite atraer capital de socios industriales e inversores privados.